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早在前2世纪后半期，在印尼出现了最早的国家叶调。公元三至七世纪，印尼境内分布着很多小王国和部落。

七至十一世纪，大国室利佛逝与中国使者商旅不绝于途。7世纪到14世纪之间，佛教在印尼传播，13世纪末14世纪初，在爪哇建立了印尼历史上最强大的满者伯夷。郑和下西洋经过了印尼，并在马六甲有外交活动。 到了16世纪，欧洲人抵达现印尼，发现了这些小国。一些欧洲强国开始建立殖民地，荷兰变成了这些欧洲国家里面占领最多领土的国家。荷兰最初通过荷兰东印度公司对这些地区实行殖民统治。1799年东印度公司解散后殖民地被荷兰政府接管，史称荷属东印度。